Script para cálculo do LPI baseado nas instruções disponíveis neste link.
Função prepara dados do icmbio e chama funções do pacote rlpi
Em fase de TESTE
Adaptação: Elildo Carvalho Jr, ICMBio/CENAP.
Colaboração: Fernando Lima
library(here)## here() starts at D:/git/monitoraFlorestalGloballibrary(tidyverse)## -- Attaching packages --------------------------------------- tidyverse 1.3.1 --## v ggplot2 3.3.5 v purrr 0.3.4
## v tibble 3.1.6 v dplyr 1.0.8
## v tidyr 1.2.0 v stringr 1.4.0
## v readr 2.1.2 v forcats 0.5.1## -- Conflicts ------------------------------------------ tidyverse_conflicts() --
## x dplyr::filter() masks stats::filter()
## x dplyr::lag() masks stats::lag()library(dplyr)source(here("bin", "lpi_icmbio.R"))#Versão disponível:
#dadosICMBio <- readRDS(here("data", "dadosICMBio_2014a2018.rds"))
#Versão não disponível
dadosICMBio <- readRDS(here("data", "dadosICMBio_2014a2019.rds"))
mydata <- dadosICMBiomydata %>%
group_by(nome_UC) %>%
count()mydata %>%
group_by(binomial) %>%
count() %>%
arrange(desc(n)) %>%
filter(! binomial %in% c(
NA,
"E",
"Tinamidae",
"Cracidae",
"Sciuridae",
"Callitrichidae",
"Pitheciidae",
"Atelidae",
"Cebidae",
"Primates",
"Felidae",
"Bradypodidae",
"Cervidae"
)
) %>%
filter(! grepl('sp.', binomial)) %>%
print(n=Inf)## # A tibble: 151 x 2
## # Groups: binomial [151]
## binomial n
## <chr> <int>
## 1 Dasyprocta croconota 1897
## 2 Sapajus apella 1804
## 3 Myoprocta acouchy 1024
## 4 Dasyprocta leporina 753
## 5 Dasyprocta fuliginosa 690
## 6 Penelope jacquacu 505
## 7 Mazama americana 404
## 8 Tinamus major 384
## 9 Pauxi tuberosa 374
## 10 Pecari tajacu 371
## 11 Guerlinguetus aestuans 351
## 12 Ateles chamek 242
## 13 Odontophorus gujanensis 236
## 14 Sapajus macrocephalus 233
## 15 Saguinus midas 232
## 16 Lagothrix cana 224
## 17 Mazama nemorivaga 212
## 18 Myoprocta pratti 202
## 19 Psophia crepitans 202
## 20 Ateles paniscus 197
## 21 Crax alector 192
## 22 Nasua nasua 187
## 23 Pithecia irrorata 174
## 24 Psophia viridis 169
## 25 Tayassu pecari 144
## 26 Chiropotes albinasus 140
## 27 Cebus unicolor 125
## 28 Callicebus vieirai 122
## 29 Saguinus weddelli 114
## 30 Dasyprocta prymnolopha 111
## 31 Aburria cujubi 109
## 32 Psophia dextralis 107
## 33 Saimiri boliviensis 107
## 34 Alouatta nigerrima 106
## 35 Tamandua tetradactyla 99
## 36 Eira barbara 96
## 37 Callicebus cupreus 91
## 38 Mico humeralifer 90
## 39 Crax fasciolata 88
## 40 Alouatta macconnelli 87
## 41 Saguinus imperator 87
## 42 Ateles marginatus 86
## 43 Alouatta puruensis 84
## 44 Saimiri ustus 78
## 45 Odontophorus stellatus 75
## 46 Psophia leucoptera 75
## 47 Callicebus brunneus 61
## 48 Ortalis motmot 61
## 49 Callicebus moloch 57
## 50 Pithecia pithecia 56
## 51 Chiropotes sagulatus 54
## 52 Mico melanurus 54
## 53 Saimiri collinsi 52
## 54 Sciurillus pusillus 51
## 55 Callicebus hoffmannsi 49
## 56 Tapirus terrestris 49
## 57 Aotus nigriceps 48
## 58 Cebus olivaceus 48
## 59 Guerlinguetus ignitus 48
## 60 Penelope marail 46
## 61 Urosciurus igniventris 46
## 62 Sapajus cay 44
## 63 Microsciurus flaviventer 39
## 64 Sapajus nigritus 39
## 65 Ortalis guttata 38
## 66 Callicebus bernhardi 37
## 67 Saguinus niger 34
## 68 Guerlinguetus gilvigularis 32
## 69 Aburria cumanensis 29
## 70 Alouatta belzebul 28
## 71 Mico argentatus 28
## 72 Myrmecophaga tridactyla 28
## 73 Panthera onca 28
## 74 Cebus albifrons 26
## 75 Saimiri sciureus 26
## 76 Chiropotes chiropotes 24
## 77 Mico rondoni 24
## 78 Puma concolor 21
## 79 Psophia interjecta 20
## 80 Ateles belzebuth 18
## 81 Bradypus variegatus 17
## 82 Penelope obscura 17
## 83 Dasypus novemcinctus 16
## 84 Callimico goeldii 15
## 85 Dasyprocta cf. fuliginosa 15
## 86 Leopardus wiedii 15
## 87 Chiropotes satanas 14
## 88 Odontophorus capueira 14
## 89 Cuniculus paca 13
## 90 Choloepus didactylus 12
## 91 Lagothrix poeppigii 11
## 92 Leopardus pardalis 11
## 93 Tinamus solitarius 11
## 94 Galictis vittata 10
## 95 Pithecia monachus 10
## 96 Cabassous unicinctus 9
## 97 Alouatta juara 8
## 98 Callithrix penicillata 8
## 99 Cerdocyon thous 8
## 100 Chiropotes utahickae 8
## 101 Guerlinguetus ingrami 8
## 102 Psophia obscura 8
## 103 Cacajao melanocephalus 7
## 104 Callicebus cinerascens 7
## 105 Didelphis marsupialis 7
## 106 Leopardus tigrinus 7
## 107 Mico emiliae 7
## 108 Saimiri cassiquiarensis 7
## 109 Brachyteles arachnoides 6
## 110 bradypus variegatus 6
## 111 Dasyprocta azarae 6
## 112 Dasyprocta iacki 6
## 113 Nothocrax urumutum 6
## 114 Puma yagouaroundi 6
## 115 Saimiri macrodon 6
## 116 Callicebus baptista 5
## 117 Coendou prehensilis 5
## 118 Crax globulosa 5
## 119 Dasypodidae 5
## 120 Hydrochoerus hydrochaeris 5
## 121 Lontra longicaudis 5
## 122 Priodontes maximus 5
## 123 Atelocynus microtis 4
## 124 Pauxi tomentosa 4
## 125 Alouatta discolor 3
## 126 Alouatta seniculus 3
## 127 Callicebus dubius 3
## 128 Callithrix jacchus 3
## 129 Canis familiaris 3
## 130 Cebus kaapori 3
## 131 Pteronura brasiliensis 3
## 132 Rhynchotus rufescens 3
## 133 Alouatta caraya 2
## 134 Aotus infulatus 2
## 135 Cyclopes didactylus 2
## 136 Dasypus kappleri 2
## 137 Mazama gouazoubira 2
## 138 Sylvilagus brasiliensis 2
## 139 Tapirus kabomani 2
## 140 Tayassuidae 2
## 141 Alouatta guariba 1
## 142 Alouatta guariba clamitans 1
## 143 Callicebus lugens 1
## 144 Callithrix aurita 1
## 145 Cebuella pygmaea 1
## 146 Colinus cristatus 1
## 147 Lontra longicaudata 1
## 148 Ozotocerus bezoarticus 1
## 149 Procyon cancrivorus 1
## 150 Procyonidae 1
## 151 Speothus venaticus 1mydata %>%
filter(! binomial %in% c(
NA,
"E",
"Tinamidae",
"Cracidae",
"Sciuridae",
"Callitrichidae",
"Pitheciidae",
"Atelidae",
"Cebidae",
"Primates",
"Felidae",
"Bradypodidae",
"Cervidae"
)
) %>%
group_by(populacao) %>%
count() %>%
arrange(desc(n)) %>%
filter(! grepl('sp.', populacao)) %>%
filter() %>%
print(n=Inf)## # A tibble: 731 x 2
## # Groups: populacao [731]
## populacao n
## <chr> <int>
## 1 Dasyprocta_croconota_259 998
## 2 Myoprocta_acouchy_213 880
## 3 Dasyprocta_croconota_47 334
## 4 Sapajus_apella_259 294
## 5 Dasyprocta_croconota_151 290
## 6 Dasyprocta_leporina_213 264
## 7 Dasyprocta_leporina_1810 231
## 8 Tinamus_major_213 230
## 9 Dasyprocta_croconota_258 225
## 10 Sapajus_apella_213 205
## 11 Sapajus_apella_151 202
## 12 Ateles_paniscus_213 152
## 13 Dasyprocta_fuliginosa_208 148
## 14 Sapajus_apella_47 142
## 15 Crax_alector_213 136
## 16 Penelope_jacquacu_232 128
## 17 Sapajus_apella_169 126
## 18 Saguinus_midas_187 116
## 19 Tinamus_major_187 116
## 20 Dasyprocta_fuliginosa_232 115
## 21 Dasyprocta_leporina_211 114
## 22 Lagothrix_cana_208 112
## 23 Dasyprocta_fuliginosa_281 107
## 24 Sapajus_apella_258 104
## 25 Psophia_crepitans_213 102
## 26 Sapajus_apella_256 101
## 27 Sapajus_apella_281 98
## 28 Sapajus_macrocephalus_232 98
## 29 Sapajus_apella_118 96
## 30 Ateles_chamek_281 94
## 31 Dasyprocta_fuliginosa_118 94
## 32 Callicebus_vieirai_47 92
## 33 Guerlinguetus_aestuans_47 89
## 34 Myoprocta_acouchy_187 89
## 35 Psophia_viridis_259 89
## 36 Sapajus_apella_173 88
## 37 Penelope_jacquacu_274 87
## 38 Mazama_americana_259 86
## 39 Nasua_nasua_259 86
## 40 Dasyprocta_leporina_187 85
## 41 Alouatta_nigerrima_259 82
## 42 Dasyprocta_prymnolopha_207 80
## 43 Lagothrix_cana_281 78
## 44 Pecari_tajacu_232 77
## 45 Pauxi_tuberosa_281 72
## 46 Mico_humeralifer_259 71
## 47 Penelope_jacquacu_208 69
## 48 Sapajus_macrocephalus_222 69
## 49 Pauxi_tuberosa_47 68
## 50 Myoprocta_pratti_173 66
## 51 Sapajus_apella_136 66
## 52 Odontophorus_gujanensis_47 64
## 53 Saguinus_midas_169 61
## 54 Sapajus_apella_188 57
## 55 Penelope_jacquacu_1633 56
## 56 Psophia_crepitans_187 56
## 57 Saguinus_midas_213 55
## 58 Callicebus_cupreus_232 54
## 59 Chiropotes_sagulatus_213 54
## 60 Penelope_jacquacu_222 54
## 61 Guerlinguetus_aestuans_151 53
## 62 Mico_melanurus_281 53
## 63 Myoprocta_acouchy_169 53
## 64 Myoprocta_pratti_232 52
## 65 Sapajus_apella_1810 52
## 66 Guerlinguetus_aestuans_213 51
## 67 Saimiri_boliviensis_232 51
## 68 Ateles_chamek_118 50
## 69 Dasyprocta_croconota_136 50
## 70 Sapajus_apella_187 50
## 71 Dasyprocta_fuliginosa_188 49
## 72 Penelope_jacquacu_173 49
## 73 Sapajus_macrocephalus_1633 49
## 74 Chiropotes_albinasus_259 48
## 75 Dasyprocta_leporina_169 48
## 76 Guerlinguetus_ignitus_232 48
## 77 Odontophorus_gujanensis_258 48
## 78 Pecari_tajacu_259 48
## 79 Myoprocta_pratti_274 47
## 80 Saguinus_weddelli_118 47
## 81 Cebus_unicolor_259 46
## 82 Pithecia_irrorata_259 46
## 83 Saimiri_boliviensis_222 46
## 84 Chiropotes_albinasus_208 45
## 85 Mazama_americana_213 45
## 86 Sapajus_cay_143 44
## 87 Mazama_nemorivaga_259 43
## 88 Saguinus_imperator_222 43
## 89 Sapajus_apella_208 43
## 90 Pauxi_tuberosa_208 42
## 91 Alouatta_puruensis_232 41
## 92 Cebus_unicolor_232 41
## 93 Dasyprocta_fuliginosa_256 41
## 94 Crax_fasciolata_47 40
## 95 Dasyprocta_fuliginosa_222 40
## 96 Alouatta_macconnelli_187 39
## 97 Callicebus_hoffmannsi_259 39
## 98 Pauxi_tuberosa_118 39
## 99 Sapajus_apella_211 39
## 100 Odontophorus_gujanensis_213 38
## 101 Urosciurus_igniventris_173 38
## 102 Callicebus_bernhardi_208 37
## 103 Callicebus_cupreus_222 37
## 104 Callicebus_moloch_258 37
## 105 Mazama_americana_258 37
## 106 Penelope_jacquacu_149 37
## 107 Ateles_marginatus_151 36
## 108 Mazama_americana_208 36
## 109 Pauxi_tuberosa_258 36
## 110 Psophia_leucoptera_232 36
## 111 Aotus_nigriceps_232 35
## 112 Ateles_chamek_208 35
## 113 Callicebus_brunneus_188 35
## 114 Odontophorus_gujanensis_151 35
## 115 Psophia_dextralis_151 35
## 116 Lagothrix_cana_1633 34
## 117 Tinamus_major_169 34
## 118 Alouatta_macconnelli_213 33
## 119 Psophia_dextralis_258 33
## 120 Alouatta_puruensis_222 32
## 121 Crax_alector_187 32
## 122 Guerlinguetus_gilvigularis_1810 32
## 123 Pauxi_tuberosa_151 32
## 124 Pauxi_tuberosa_259 32
## 125 Sapajus_nigritus_172 32
## 126 Chiropotes_albinasus_281 31
## 127 Dasyprocta_prymnolopha_57 31
## 128 Mazama_nemorivaga_208 31
## 129 Pecari_tajacu_213 31
## 130 Saguinus_weddelli_232 31
## 131 Sciurillus_pusillus_169 31
## 132 Callicebus_vieirai_151 30
## 133 Pithecia_pithecia_173 30
## 134 Psophia_crepitans_169 30
## 135 Tayassu_pecari_151 30
## 136 Ateles_paniscus_187 29
## 137 Odontophorus_stellatus_232 29
## 138 Odontophorus_stellatus_274 29
## 139 Dasyprocta_fuliginosa_221 28
## 140 Mico_argentatus_1810 28
## 141 Pithecia_irrorata_274 28
## 142 Psophia_viridis_208 28
## 143 Saimiri_collinsi_47 28
## 144 Sapajus_apella_221 28
## 145 Ateles_marginatus_258 27
## 146 Psophia_dextralis_47 27
## 147 Saguinus_imperator_232 27
## 148 Saguinus_niger_211 27
## 149 Aburria_cujubi_151 26
## 150 Ateles_chamek_188 25
## 151 Crax_fasciolata_151 25
## 152 Mazama_americana_232 25
## 153 Psophia_viridis_281 25
## 154 Chiropotes_chiropotes_189 24
## 155 Mazama_americana_47 24
## 156 Mico_rondoni_118 24
## 157 Pecari_tajacu_151 24
## 158 Guerlinguetus_aestuans_259 23
## 159 Nasua_nasua_232 23
## 160 Penelope_marail_169 23
## 161 Penelope_marail_187 23
## 162 Aburria_cujubi_259 22
## 163 Mazama_americana_211 22
## 164 Mazama_nemorivaga_187 22
## 165 Odontophorus_gujanensis_259 22
## 166 Pecari_tajacu_281 22
## 167 Saimiri_collinsi_211 22
## 168 Alouatta_nigerrima_1810 21
## 169 Dasyprocta_fuliginosa_274 21
## 170 Guerlinguetus_aestuans_207 21
## 171 Myoprocta_pratti_259 21
## 172 Saimiri_ustus_118 21
## 173 Pithecia_irrorata_118 20
## 174 Psophia_interjecta_211 20
## 175 Mazama_americana_281 19
## 176 Mico_humeralifer_136 19
## 177 Pithecia_irrorata_1633 19
## 178 Aburria_cujubi_281 18
## 179 Dasyprocta_fuliginosa_149 18
## 180 Guerlinguetus_aestuans_169 18
## 181 Guerlinguetus_aestuans_173 18
## 182 Mazama_nemorivaga_281 18
## 183 Microsciurus_flaviventer_232 18
## 184 Pauxi_tuberosa_211 18
## 185 Saguinus_weddelli_222 18
## 186 Ateles_chamek_256 17
## 187 Cebus_albifrons_1633 17
## 188 Dasyprocta_fuliginosa_173 17
## 189 Pithecia_irrorata_281 17
## 190 Saguinus_imperator_274 17
## 191 Aburria_cujubi_258 16
## 192 Ateles_paniscus_169 16
## 193 Crax_fasciolata_211 16
## 194 Guerlinguetus_aestuans_211 16
## 195 Mazama_nemorivaga_213 16
## 196 Pithecia_irrorata_208 16
## 197 Psophia_viridis_118 16
## 198 Saimiri_ustus_256 16
## 199 Sapajus_macrocephalus_274 16
## 200 Tayassu_pecari_57 16
## 201 Alouatta_belzebul_207 15
## 202 Ateles_belzebuth_57 15
## 203 Dasyprocta_cf. fuliginosa_274 15
## 204 Ortalis_guttata_222 15
## 205 Penelope_obscura_142 15
## 206 Alouatta_macconnelli_169 14
## 207 Ateles_chamek_149 14
## 208 Ateles_marginatus_47 14
## 209 Callimico_goeldii_232 14
## 210 Chiropotes_satanas_207 14
## 211 Crax_alector_57 14
## 212 Eira_barbara_213 14
## 213 Eira_barbara_232 14
## 214 Mazama_americana_169 14
## 215 Mazama_americana_1810 14
## 216 Pecari_tajacu_118 14
## 217 Penelope_jacquacu_189 14
## 218 Psophia_leucoptera_274 14
## 219 Saimiri_ustus_281 14
## 220 Tamandua_tetradactyla_151 14
## 221 Tayassu_pecari_259 14
## 222 Tayassu_pecari_281 14
## 223 Callicebus_brunneus_118 13
## 224 Cebus_olivaceus_189 13
## 225 Guerlinguetus_aestuans_258 13
## 226 Mazama_americana_151 13
## 227 Mazama_nemorivaga_188 13
## 228 Nasua_nasua_151 13
## 229 Ortalis_motmot_151 13
## 230 Pecari_tajacu_208 13
## 231 Pecari_tajacu_256 13
## 232 Pecari_tajacu_258 13
## 233 Saguinus_weddelli_188 13
## 234 Sapajus_apella_207 13
## 235 Tayassu_pecari_118 13
## 236 Alouatta_belzebul_211 12
## 237 Cebus_olivaceus_60 12
## 238 Cebus_unicolor_222 12
## 239 Dasyprocta_fuliginosa_1633 12
## 240 Eira_barbara_259 12
## 241 Ortalis_motmot_60 12
## 242 Pecari_tajacu_1633 12
## 243 Pecari_tajacu_173 12
## 244 Pecari_tajacu_187 12
## 245 Pecari_tajacu_222 12
## 246 Tamandua_tetradactyla_232 12
## 247 Aburria_cujubi_47 11
## 248 Aburria_cumanensis_149 11
## 249 Aburria_cumanensis_213 11
## 250 Dasyprocta_leporina_189 11
## 251 Guerlinguetus_aestuans_188 11
## 252 Mazama_americana_57 11
## 253 Mazama_nemorivaga_169 11
## 254 Microsciurus_flaviventer_173 11
## 255 Ortalis_guttata_259 11
## 256 Pauxi_tuberosa_1810 11
## 257 Pecari_tajacu_47 11
## 258 Penelope_jacquacu_60 11
## 259 Pithecia_irrorata_188 11
## 260 Tamandua_tetradactyla_208 11
## 261 Alouatta_puruensis_281 10
## 262 Callicebus_hoffmannsi_136 10
## 263 Guerlinguetus_aestuans_187 10
## 264 Guerlinguetus_aestuans_274 10
## 265 Lagothrix_poeppigii_149 10
## 266 Odontophorus_stellatus_222 10
## 267 Pecari_tajacu_207 10
## 268 Pithecia_monachus_149 10
## 269 Psophia_crepitans_57 10
## 270 Psophia_leucoptera_1633 10
## 271 Saimiri_sciureus_213 10
## 272 Tamandua_tetradactyla_213 10
## 273 Aburria_cujubi_211 9
## 274 Ateles_marginatus_1810 9
## 275 Bradypus_variegatus_259 9
## 276 Callicebus_brunneus_256 9
## 277 Callicebus_moloch_1810 9
## 278 Cebus_olivaceus_57 9
## 279 Chiropotes_albinasus_136 9
## 280 Crax_alector_169 9
## 281 Mazama_americana_187 9
## 282 Mazama_nemorivaga_118 9
## 283 Myoprocta_pratti_149 9
## 284 Odontophorus_gujanensis_173 9
## 285 Ortalis_motmot_211 9
## 286 Pithecia_pithecia_187 9
## 287 Pithecia_pithecia_213 9
## 288 Psophia_dextralis_1810 9
## 289 Saimiri_sciureus_169 9
## 290 Tayassu_pecari_211 9
## 291 Callithrix_penicillata_148 8
## 292 Chiropotes_utahickae_211 8
## 293 Myrmecophaga_tridactyla_259 8
## 294 Nasua_nasua_47 8
## 295 Odontophorus_capueira_152 8
## 296 Odontophorus_gujanensis_211 8
## 297 Pecari_tajacu_169 8
## 298 Pithecia_pithecia_169 8
## 299 Psophia_leucoptera_149 8
## 300 Psophia_obscura_207 8
## 301 Tamandua_tetradactyla_259 8
## 302 Tapirus_terrestris_281 8
## 303 Urosciurus_igniventris_57 8
## 304 Cacajao_melanocephalus_173 7
## 305 Callicebus_cinerascens_281 7
## 306 Chiropotes_albinasus_258 7
## 307 Guerlinguetus_aestuans_281 7
## 308 Mazama_americana_207 7
## 309 Mazama_americana_222 7
## 310 Mazama_nemorivaga_1810 7
## 311 Nasua_nasua_118 7
## 312 Pauxi_tuberosa_256 7
## 313 Pecari_tajacu_221 7
## 314 Pithecia_irrorata_221 7
## 315 Psophia_leucoptera_222 7
## 316 Saguinus_niger_207 7
## 317 Saimiri_sciureus_187 7
## 318 Saimiri_ustus_208 7
## 319 Sciurillus_pusillus_187 7
## 320 Tapirus_terrestris_213 7
## 321 Tayassu_pecari_222 7
## 322 Tayassu_pecari_47 7
## 323 Brachyteles_arachnoides_152 6
## 324 Callicebus_moloch_281 6
## 325 Cebus_olivaceus_169 6
## 326 Cebus_unicolor_149 6
## 327 Cebus_unicolor_281 6
## 328 Dasyprocta_iacki_196 6
## 329 Galictis_vittata_259 6
## 330 Mazama_americana_188 6
## 331 Mazama_nemorivaga_173 6
## 332 Mazama_nemorivaga_256 6
## 333 Mazama_nemorivaga_47 6
## 334 Mico_emiliae_151 6
## 335 Microsciurus_flaviventer_274 6
## 336 Myrmecophaga_tridactyla_232 6
## 337 Nasua_nasua_211 6
## 338 Odontophorus_stellatus_149 6
## 339 Ortalis_guttata_136 6
## 340 Ortalis_motmot_57 6
## 341 Pauxi_tuberosa_136 6
## 342 Pecari_tajacu_211 6
## 343 Pithecia_irrorata_256 6
## 344 Psophia_viridis_136 6
## 345 Saimiri_boliviensis_258 6
## 346 Saimiri_cassiquiarensis_173 6
## 347 Saimiri_macrodon_149 6
## 348 Saimiri_ustus_1810 6
## 349 Saimiri_ustus_259 6
## 350 Sapajus_nigritus_152 6
## 351 Tapirus_terrestris_47 6
## 352 Tapirus_terrestris_57 6
## 353 Aburria_cumanensis_143 5
## 354 Alouatta_juara_173 5
## 355 Ateles_chamek_221 5
## 356 Callicebus_baptista_136 5
## 357 Callicebus_moloch_211 5
## 358 Cebus_albifrons_173 5
## 359 Cebus_olivaceus_187 5
## 360 Cebus_unicolor_256 5
## 361 Choloepus_didactylus_259 5
## 362 Crax_globulosa_1633 5
## 363 Dasypodidae_259 5
## 364 Dasyprocta_azarae_172 5
## 365 Dasypus_novemcinctus_259 5
## 366 Eira_barbara_118 5
## 367 Eira_barbara_173 5
## 368 Eira_barbara_281 5
## 369 Eira_barbara_284 5
## 370 Guerlinguetus_ingrami_142 5
## 371 Mazama_americana_118 5
## 372 Mazama_americana_149 5
## 373 Myoprocta_pratti_222 5
## 374 Nasua_nasua_169 5
## 375 Nasua_nasua_187 5
## 376 Nasua_nasua_208 5
## 377 Nasua_nasua_213 5
## 378 Nasua_nasua_281 5
## 379 Odontophorus_gujanensis_207 5
## 380 Odontophorus_gujanensis_57 5
## 381 Ortalis_motmot_189 5
## 382 Ortalis_motmot_213 5
## 383 Panthera_onca_259 5
## 384 Pauxi_tuberosa_189 5
## 385 Saguinus_weddelli_256 5
## 386 Sciurillus_pusillus_211 5
## 387 Tamandua_tetradactyla_188 5
## 388 Tamandua_tetradactyla_274 5
## 389 Tayassu_pecari_256 5
## 390 Tinamus_solitarius_172 5
## 391 Aotus_nigriceps_281 4
## 392 Bradypus_variegatus_196 4
## 393 Cabassous_unicinctus_232 4
## 394 Cebus_unicolor_173 4
## 395 Choloepus_didactylus_169 4
## 396 Didelphis_marsupialis_259 4
## 397 Eira_barbara_208 4
## 398 Guerlinguetus_aestuans_221 4
## 399 Mazama_americana_173 4
## 400 Mazama_americana_274 4
## 401 Mazama_nemorivaga_151 4
## 402 Mazama_nemorivaga_211 4
## 403 Nothocrax_urumutum_232 4
## 404 Ortalis_motmot_47 4
## 405 Panthera_onca_187 4
## 406 Panthera_onca_213 4
## 407 Panthera_onca_281 4
## 408 Pauxi_tomentosa_60 4
## 409 Pecari_tajacu_188 4
## 410 Psophia_crepitans_189 4
## 411 Puma_concolor_259 4
## 412 Saimiri_ustus_258 4
## 413 Tamandua_tetradactyla_118 4
## 414 Tamandua_tetradactyla_211 4
## 415 Tamandua_tetradactyla_47 4
## 416 Tapirus_terrestris_259 4
## 417 Tayassu_pecari_169 4
## 418 Tayassu_pecari_208 4
## 419 Tinamus_solitarius_142 4
## 420 Aburria_cujubi_136 3
## 421 Alouatta_juara_274 3
## 422 Alouatta_nigerrima_136 3
## 423 Alouatta_seniculus_57 3
## 424 Aotus_nigriceps_222 3
## 425 Aotus_nigriceps_259 3
## 426 Ateles_belzebuth_189 3
## 427 bradypus_variegatus_259 3
## 428 Callicebus_brunneus_208 3
## 429 Callicebus_dubius_1633 3
## 430 Cebus_kaapori_207 3
## 431 Cebus_olivaceus_213 3
## 432 Cebus_unicolor_274 3
## 433 Coendou_prehensilis_259 3
## 434 Crax_fasciolata_143 3
## 435 Cuniculus_paca_187 3
## 436 Cuniculus_paca_259 3
## 437 Eira_barbara_187 3
## 438 Eira_barbara_211 3
## 439 Eira_barbara_258 3
## 440 Eira_barbara_274 3
## 441 Guerlinguetus_ingrami_152 3
## 442 Leopardus_pardalis_259 3
## 443 Leopardus_tigrinus_232 3
## 444 Leopardus_wiedii_213 3
## 445 Leopardus_wiedii_232 3
## 446 Leopardus_wiedii_259 3
## 447 Mazama_americana_136 3
## 448 Mazama_americana_143 3
## 449 Mazama_nemorivaga_1626 3
## 450 Mazama_nemorivaga_210 3
## 451 Microsciurus_flaviventer_222 3
## 452 Myrmecophaga_tridactyla_213 3
## 453 Nasua_nasua_222 3
## 454 Nasua_nasua_256 3
## 455 Nasua_nasua_274 3
## 456 Odontophorus_capueira_142 3
## 457 Odontophorus_capueira_172 3
## 458 Ortalis_guttata_274 3
## 459 Ortalis_motmot_169 3
## 460 Panthera_onca_232 3
## 461 Pauxi_tuberosa_207 3
## 462 Pecari_tajacu_136 3
## 463 Pecari_tajacu_149 3
## 464 Pecari_tajacu_1626 3
## 465 Pecari_tajacu_172 3
## 466 Pithecia_irrorata_222 3
## 467 Psophia_dextralis_281 3
## 468 Psophia_viridis_188 3
## 469 Pteronura_brasiliensis_173 3
## 470 Puma_concolor_213 3
## 471 Saimiri_boliviensis_1633 3
## 472 Sciurillus_pusillus_259 3
## 473 Tamandua_tetradactyla_187 3
## 474 Tamandua_tetradactyla_222 3
## 475 Tamandua_tetradactyla_256 3
## 476 Tamandua_tetradactyla_281 3
## 477 Tapirus_terrestris_143 3
## 478 Tapirus_terrestris_208 3
## 479 Tayassu_pecari_136 3
## 480 Tayassu_pecari_187 3
## 481 Tayassu_pecari_213 3
## 482 Tinamus_major_189 3
## 483 Aburria_cujubi_1810 2
## 484 Aburria_cujubi_207 2
## 485 Alouatta_caraya_143 2
## 486 Alouatta_discolor_258 2
## 487 Aotus_nigriceps_1633 2
## 488 bradypus_variegatus_169 2
## 489 Cabassous_unicinctus_259 2
## 490 Callithrix_jacchus_196 2
## 491 Cebus_albifrons_136 2
## 492 Cebus_albifrons_274 2
## 493 Cebus_unicolor_136 2
## 494 Cerdocyon_thous_208 2
## 495 Cerdocyon_thous_256 2
## 496 Cerdocyon_thous_259 2
## 497 Cerdocyon_thous_281 2
## 498 Choloepus_didactylus_173 2
## 499 Crax_fasciolata_256 2
## 500 Crax_fasciolata_281 2
## 501 Cuniculus_paca_136 2
## 502 Cuniculus_paca_211 2
## 503 Dasypus_novemcinctus_187 2
## 504 Dasypus_novemcinctus_232 2
## 505 Dasypus_novemcinctus_281 2
## 506 Didelphis_marsupialis_281 2
## 507 Eira_barbara_169 2
## 508 Eira_barbara_1810 2
## 509 Eira_barbara_188 2
## 510 Eira_barbara_207 2
## 511 Eira_barbara_222 2
## 512 Eira_barbara_57 2
## 513 Eira_barbara_60 2
## 514 Galictis_vittata_281 2
## 515 Guerlinguetus_aestuans_196 2
## 516 Guerlinguetus_aestuans_222 2
## 517 Hydrochoerus_hydrochaeris_281 2
## 518 Leopardus_pardalis_281 2
## 519 Leopardus_wiedii_1810 2
## 520 Leopardus_wiedii_258 2
## 521 Lontra_longicaudis_173 2
## 522 Mazama_americana_1633 2
## 523 Mazama_americana_256 2
## 524 Mazama_gouazoubira_76 2
## 525 Mazama_nemorivaga_221 2
## 526 Mazama_nemorivaga_222 2
## 527 Mazama_nemorivaga_258 2
## 528 Myoprocta_acouchy_57 2
## 529 Myoprocta_pratti_281 2
## 530 Myrmecophaga_tridactyla_57 2
## 531 Nasua_nasua_136 2
## 532 Nasua_nasua_143 2
## 533 Nasua_nasua_1810 2
## 534 Odontophorus_gujanensis_187 2
## 535 Ortalis_guttata_232 2
## 536 Ortalis_motmot_1810 2
## 537 Ortalis_motmot_258 2
## 538 Panthera_onca_118 2
## 539 Panthera_onca_208 2
## 540 Panthera_onca_274 2
## 541 Pauxi_tuberosa_232 2
## 542 Pecari_tajacu_143 2
## 543 Pecari_tajacu_1810 2
## 544 Pecari_tajacu_210 2
## 545 Pecari_tajacu_274 2
## 546 Penelope_obscura_152 2
## 547 Priodontes_maximus_281 2
## 548 Psophia_viridis_256 2
## 549 Puma_concolor_136 2
## 550 Puma_concolor_173 2
## 551 Puma_concolor_258 2
## 552 Puma_concolor_47 2
## 553 Rhynchotus_rufescens_76 2
## 554 Saimiri_collinsi_207 2
## 555 Saimiri_ustus_136 2
## 556 Sciurillus_pusillus_136 2
## 557 Sciurillus_pusillus_281 2
## 558 Tamandua_tetradactyla_143 2
## 559 Tamandua_tetradactyla_173 2
## 560 Tamandua_tetradactyla_285 2
## 561 Tapirus_kabomani_188 2
## 562 Tapirus_terrestris_118 2
## 563 Tapirus_terrestris_1633 2
## 564 Tapirus_terrestris_188 2
## 565 Tayassu_pecari_149 2
## 566 Tayassu_pecari_1633 2
## 567 Tayassu_pecari_173 2
## 568 Tayassu_pecari_232 2
## 569 Aburria_cumanensis_232 1
## 570 Aburria_cumanensis_57 1
## 571 Alouatta_belzebul_196 1
## 572 Alouatta_discolor_47 1
## 573 Alouatta_guariba clamitans_152 1
## 574 Alouatta_guariba_142 1
## 575 Alouatta_macconnelli_189 1
## 576 Alouatta_puruensis_188 1
## 577 Aotus_infulatus_151 1
## 578 Aotus_infulatus_169 1
## 579 Aotus_nigriceps_258 1
## 580 Ateles_chamek_1633 1
## 581 Ateles_chamek_259 1
## 582 Atelocynus_microtis_136 1
## 583 Atelocynus_microtis_1626 1
## 584 Atelocynus_microtis_208 1
## 585 Atelocynus_microtis_211 1
## 586 Bradypus_variegatus_151 1
## 587 bradypus_variegatus_211 1
## 588 Bradypus_variegatus_211 1
## 589 Bradypus_variegatus_213 1
## 590 Bradypus_variegatus_274 1
## 591 Cabassous_unicinctus_118 1
## 592 Cabassous_unicinctus_221 1
## 593 Cabassous_unicinctus_281 1
## 594 Callicebus_brunneus_221 1
## 595 Callicebus_lugens_189 1
## 596 Callimico_goeldii_222 1
## 597 Callithrix_aurita_142 1
## 598 Callithrix_jacchus_142 1
## 599 Canis_familiaris_148 1
## 600 Canis_familiaris_152 1
## 601 Canis_familiaris_274 1
## 602 Cebuella_pygmaea_222 1
## 603 Choloepus_didactylus_208 1
## 604 Coendou_prehensilis_222 1
## 605 Coendou_prehensilis_281 1
## 606 Colinus_cristatus_169 1
## 607 Crax_alector_60 1
## 608 Cuniculus_paca_1810 1
## 609 Cuniculus_paca_256 1
## 610 Cuniculus_paca_284 1
## 611 Cyclopes_didactylus_213 1
## 612 Cyclopes_didactylus_259 1
## 613 Dasyprocta_azarae_143 1
## 614 Dasypus_kappleri_211 1
## 615 Dasypus_kappleri_256 1
## 616 Dasypus_novemcinctus_213 1
## 617 Dasypus_novemcinctus_221 1
## 618 Dasypus_novemcinctus_222 1
## 619 Dasypus_novemcinctus_256 1
## 620 Dasypus_novemcinctus_76 1
## 621 Didelphis_marsupialis_47 1
## 622 Eira_barbara_142 1
## 623 Eira_barbara_151 1
## 624 Eira_barbara_152 1
## 625 Eira_barbara_1633 1
## 626 Eira_barbara_210 1
## 627 Eira_barbara_285 1
## 628 Galictis_vittata_213 1
## 629 Galictis_vittata_232 1
## 630 Guerlinguetus_aestuans_118 1
## 631 Guerlinguetus_aestuans_136 1
## 632 Guerlinguetus_aestuans_189 1
## 633 Hydrochoerus_hydrochaeris_118 1
## 634 Hydrochoerus_hydrochaeris_210 1
## 635 Hydrochoerus_hydrochaeris_211 1
## 636 Lagothrix_poeppigii_274 1
## 637 Leopardus_pardalis_1633 1
## 638 Leopardus_pardalis_173 1
## 639 Leopardus_pardalis_187 1
## 640 Leopardus_pardalis_213 1
## 641 Leopardus_pardalis_232 1
## 642 Leopardus_pardalis_57 1
## 643 Leopardus_tigrinus_169 1
## 644 Leopardus_tigrinus_173 1
## 645 Leopardus_tigrinus_259 1
## 646 Leopardus_tigrinus_57 1
## 647 Leopardus_wiedii_169 1
## 648 Leopardus_wiedii_208 1
## 649 Lontra_longicaudata_274 1
## 650 Lontra_longicaudis_1633 1
## 651 Lontra_longicaudis_259 1
## 652 Lontra_longicaudis_274 1
## 653 Mazama_americana_210 1
## 654 Mazama_nemorivaga_136 1
## 655 Mazama_nemorivaga_149 1
## 656 Mazama_nemorivaga_1633 1
## 657 Mazama_nemorivaga_284 1
## 658 Mico_emiliae_47 1
## 659 Mico_melanurus_208 1
## 660 Microsciurus_flaviventer_57 1
## 661 Myrmecophaga_tridactyla_118 1
## 662 Myrmecophaga_tridactyla_188 1
## 663 Myrmecophaga_tridactyla_208 1
## 664 Myrmecophaga_tridactyla_211 1
## 665 Myrmecophaga_tridactyla_222 1
## 666 Myrmecophaga_tridactyla_256 1
## 667 Myrmecophaga_tridactyla_258 1
## 668 Myrmecophaga_tridactyla_281 1
## 669 Myrmecophaga_tridactyla_47 1
## 670 Nasua_nasua_172 1
## 671 Nasua_nasua_207 1
## 672 Nasua_nasua_241 1
## 673 Nasua_nasua_258 1
## 674 Nothocrax_urumutum_173 1
## 675 Nothocrax_urumutum_208 1
## 676 Odontophorus_stellatus_151 1
## 677 Ortalis_guttata_256 1
## 678 Ozotocerus_bezoarticus_1633 1
## 679 Panthera_onca_151 1
## 680 Panthera_onca_284 1
## 681 Pauxi_tuberosa_188 1
## 682 Pecari_tajacu_285 1
## 683 Pecari_tajacu_60 1
## 684 Pithecia_irrorata_136 1
## 685 Priodontes_maximus_211 1
## 686 Priodontes_maximus_213 1
## 687 Priodontes_maximus_232 1
## 688 Procyon_cancrivorus_1626 1
## 689 Procyonidae_281 1
## 690 Puma_concolor_118 1
## 691 Puma_concolor_151 1
## 692 Puma_concolor_211 1
## 693 Puma_concolor_232 1
## 694 Puma_concolor_281 1
## 695 Puma_concolor_60 1
## 696 Puma_yagouaroundi_187 1
## 697 Puma_yagouaroundi_208 1
## 698 Puma_yagouaroundi_222 1
## 699 Puma_yagouaroundi_232 1
## 700 Puma_yagouaroundi_259 1
## 701 Puma_yagouaroundi_281 1
## 702 Rhynchotus_rufescens_148 1
## 703 Saimiri_boliviensis_274 1
## 704 Saimiri_cassiquiarensis_57 1
## 705 Saimiri_ustus_151 1
## 706 Saimiri_ustus_221 1
## 707 Sapajus_macrocephalus_189 1
## 708 Sapajus_nigritus_142 1
## 709 Sciurillus_pusillus_188 1
## 710 Speothus_venaticus_232 1
## 711 Sylvilagus_brasiliensis_118 1
## 712 Sylvilagus_brasiliensis_211 1
## 713 Tamandua_tetradactyla_136 1
## 714 Tamandua_tetradactyla_189 1
## 715 Tamandua_tetradactyla_207 1
## 716 Tamandua_tetradactyla_57 1
## 717 Tapirus_terrestris_169 1
## 718 Tapirus_terrestris_187 1
## 719 Tapirus_terrestris_211 1
## 720 Tapirus_terrestris_222 1
## 721 Tapirus_terrestris_258 1
## 722 Tapirus_terrestris_285 1
## 723 Tayassu_pecari_1626 1
## 724 Tayassu_pecari_1810 1
## 725 Tayassu_pecari_207 1
## 726 Tayassu_pecari_258 1
## 727 Tayassuidae_1633 1
## 728 Tayassuidae_259 1
## 729 Tinamus_major_60 1
## 730 Tinamus_solitarius_148 1
## 731 Tinamus_solitarius_152 1mydata %>%
distinct(nome_UC, estacao_amostral) %>%
count()mydata %>%
summarize(sum(esforco, na.rm = TRUE)/1000)esforco <- mydata %>%
group_by(cnuc, ano) %>%
summarize(esforco = sum(esforco, na.rm = TRUE)/1000) %>%
filter(esforco > 149) ## `summarise()` has grouped output by 'cnuc'. You can override using the
## `.groups` argument.esforco##Seleção por critérios ### Selecionar UCs Seleção de UCs com mais de 1 ano de amostragem e mais de 149 km de esforço anual.
ucs_selecionadas <- esforco %>%
group_by(cnuc) %>%
count() %>%
filter(n > 1) %>%
pull(cnuc)
ucs_selecionadas## [1] 118 151 169 173 187 188 208 211 213 222 232 256 259 274 281
## [16] 1633 1810Filtrar dados mantendo somente UCs selecionadas
mydata <- mydata %>%
filter(cnuc %in% ucs_selecionadas)
mydataRemover especies identificadas apenas ao nível de gênero
mydata <- mydata %>%
filter(! grepl('sp.', binomial))
mydataEsforço anual em km
esforco_anual <- mydata %>%
group_by(cnuc, ano) %>%
summarize(esforco = sum(esforco, na.rm = TRUE)) %>%
mutate(esforco = esforco/1000)## `summarise()` has grouped output by 'cnuc'. You can override using the
## `.groups` argument.esforco_anualEsforço anual em formato wide (QPEHE)
esforco_anual_wide <- esforco_anual %>%
pivot_wider(names_from = ano, values_from = esforco) %>%
select(cnuc,
`2014`,
`2015`,
`2016`,
`2017`,
`2018`,
`2019`
) %>%
ungroup()
esforco_anual_wideNúmero de registros anuais
n_registros <- mydata %>%
group_by(cnuc, ano, populacao) %>%
count() %>%
mutate(n = as.numeric(n))
n_registrosNúmero de registros anuais em formato wide (QPEHE)
n_registros_wide <- n_registros %>%
pivot_wider(names_from = ano, values_from = n) %>%
select(cnuc,
populacao,
`2014`,
`2015`,
`2016`,
`2017`,
`2018`,
`2019`
) %>%
replace(is.na(.), 0) %>%
ungroup()
n_registros_wideEstimativa de abundância relativa (número de registros por esforço). Neste caso NAs devem ser mantidos! Vai entender…
taxas_anuais <- data.frame(n_registros_wide)
esforcos_anuais <- data.frame(esforco_anual_wide)
for(i in 1:nrow(taxas_anuais)) {
cnuc_temp <- taxas_anuais[i, "cnuc"]
esforco_temp <- esforcos_anuais %>% filter(cnuc == cnuc_temp) %>% select(-cnuc)
taxas_anuais[i, 3:8] <- round(taxas_anuais[i, 3:8]/esforco_temp, 3)
}
taxas_anuais <- as_tibble(taxas_anuais)
taxas_anuais %>%
print(n=Inf)## # A tibble: 550 x 8
## cnuc populacao X2014 X2015 X2016 X2017 X2018 X2019
## <dbl> <chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
## 1 118 Ateles_chamek_118 0.12 0.167 0.143 0.118 0.075 0.108
## 2 118 Dasyprocta_fuliginosa_118 0.16 0.3 0.414 0.247 0.133 0.125
## 3 118 Guerlinguetus_aestuans_118 0.04 0 0 0 0 0
## 4 118 Mazama_americana_118 0.04 0 0 0.035 0.008 0
## 5 118 Mazama_nemorivaga_118 0.04 0.067 0 0 0.025 0.025
## 6 118 Myrmecophaga_tridactyla_118 0.04 0 0 0 0 0
## 7 118 Nasua_nasua_118 0.04 0.033 0.014 0.012 0.025 0
## 8 118 Pauxi_tuberosa_118 0.2 0.1 0.186 0.059 0.025 0.083
## 9 118 Pecari_tajacu_118 0.08 0.067 0.029 0.059 0.008 0.017
## 10 118 Pithecia_irrorata_118 0.04 0.067 0.057 0.071 0.033 0.025
## 11 118 Saguinus_weddelli_118 0.12 0.067 0.129 0.153 0.092 0.075
## 12 118 Sapajus_apella_118 0.28 0.067 0.286 0.271 0.175 0.192
## 13 118 Callicebus_brunneus_118 0 0.033 0.043 0.024 0.042 0.017
## 14 118 Mico_rondoni_118 0 0.133 0.057 0.047 0.067 0.033
## 15 118 Psophia_viridis_118 0 0.067 0.043 0.059 0.033 0.017
## 16 118 Tapirus_terrestris_118 0 0.033 0.014 0 0 0
## 17 118 Eira_barbara_118 0 0 0.029 0 0.017 0.008
## 18 118 NA_118 0 0 0.014 0 0 0.017
## 19 118 Saimiri_ustus_118 0 0 0.057 0.106 0.017 0.05
## 20 118 Tamandua_tetradactyla_118 0 0 0.014 0.012 0 0.017
## 21 118 Tayassu_pecari_118 0 0 0.057 0.047 0 0.042
## 22 118 Sciuridae_118 0 0 0 0.012 0 0
## 23 118 Sylvilagus_brasiliensis_118 0 0 0 0.012 0 0
## 24 118 Tinamidae_118 0 0 0 0.153 0.058 0
## 25 118 Cabassous_unicinctus_118 0 0 0 0 0.008 0
## 26 118 Hydrochoerus_hydrochaeris_118 0 0 0 0 0.008 0
## 27 118 Panthera_onca_118 0 0 0 0 0.008 0.008
## 28 118 Puma_concolor_118 0 0 0 0 0 0.008
## 29 151 Aburria_cujubi_151 NA NA 0.057 0.032 0.038 0.11
## 30 151 Ateles_marginatus_151 NA NA 0.133 0.064 0.112 0.042
## 31 151 Crax_fasciolata_151 NA NA 0.029 0.048 0.038 0.11
## 32 151 Dasyprocta_croconota_151 NA NA 0.667 0.688 0.45 0.829
## 33 151 Guerlinguetus_aestuans_151 NA NA 0.114 0.176 0.112 0.085
## 34 151 Mazama_americana_151 NA NA 0.029 0.016 0.025 0.051
## 35 151 Mazama_nemorivaga_151 NA NA 0.029 0 0 0.008
## 36 151 Mico_emiliae_151 NA NA 0.038 0 0.013 0.008
## 37 151 Nasua_nasua_151 NA NA 0.019 0.016 0.088 0.017
## 38 151 Odontophorus_gujanensis_151 NA NA 0.114 0.064 0.088 0.068
## 39 151 Ortalis_motmot_151 NA NA 0.048 0.024 0 0.042
## 40 151 Pauxi_tuberosa_151 NA NA 0.105 0.096 0.038 0.051
## 41 151 Pecari_tajacu_151 NA NA 0.048 0.104 0 0.051
## 42 151 Psophia_dextralis_151 NA NA 0.114 0.064 0.1 0.059
## 43 151 Sapajus_apella_151 NA NA 0.514 0.432 0.5 0.457
## 44 151 Tamandua_tetradactyla_151 NA NA 0.038 0.016 0.05 0.034
## 45 151 Tayassu_pecari_151 NA NA 0.086 0.064 0.062 0.068
## 46 151 Tinamidae_151 NA NA 0.01 0 0 0
## 47 151 Aotus_infulatus_151 NA NA 0 0.008 0 0
## 48 151 Callicebus_vieirai_151 NA NA 0 0.24 0 0
## 49 151 Cracidae_151 NA NA 0 0.008 0 0
## 50 151 Eira_barbara_151 NA NA 0 0.008 0 0
## 51 151 Bradypus_variegatus_151 NA NA 0 0 0.013 0
## 52 151 NA_151 NA NA 0 0 0 0.042
## 53 151 Odontophorus_stellatus_151 NA NA 0 0 0 0.008
## 54 151 Panthera_onca_151 NA NA 0 0 0 0.008
## 55 151 Puma_concolor_151 NA NA 0 0 0 0.008
## 56 151 Saimiri_ustus_151 NA NA 0 0 0 0.008
## 57 169 Alouatta_macconnelli_169 NA NA 0.035 0.047 0.023 0.028
## 58 169 Ateles_paniscus_169 NA NA 0.012 0.035 0.046 0.041
## 59 169 Cebus_olivaceus_169 NA NA 0.012 0 0 0.034
## 60 169 Crax_alector_169 NA NA 0.035 0.012 0.015 0.021
## 61 169 Dasyprocta_leporina_169 NA NA 0.188 0.141 0.092 0.055
## 62 169 Eira_barbara_169 NA NA 0.012 0.012 0 0
## 63 169 Guerlinguetus_aestuans_169 NA NA 0.047 0.035 0.054 0.028
## 64 169 Mazama_americana_169 NA NA 0.024 0.012 0.023 0.055
## 65 169 Mazama_nemorivaga_169 NA NA 0.047 0 0.008 0.041
## 66 169 Myoprocta_acouchy_169 NA NA 0.118 0.118 0.131 0.11
## 67 169 Nasua_nasua_169 NA NA 0.012 0.024 0 0.014
## 68 169 Ortalis_motmot_169 NA NA 0.024 0 0 0.007
## 69 169 Pecari_tajacu_169 NA NA 0.024 0.024 0.008 0.021
## 70 169 Penelope_marail_169 NA NA 0.082 0.024 0.077 0.028
## 71 169 Pitheciidae_169 NA NA 0.012 0 0 0
## 72 169 Psophia_crepitans_169 NA NA 0.059 0.059 0.092 0.055
## 73 169 Saguinus_midas_169 NA NA 0.106 0.071 0.231 0.11
## 74 169 Saimiri_sciureus_169 NA NA 0.047 0.024 0.015 0.007
## 75 169 Sapajus_apella_169 NA NA 0.306 0.306 0.3 0.241
## 76 169 Sciurillus_pusillus_169 NA NA 0.071 0.035 0.054 0.103
## 77 169 Tinamus_major_169 NA NA 0.059 0.071 0.069 0.097
## 78 169 Choloepus_didactylus_169 NA NA 0 0.012 0.015 0.007
## 79 169 Pithecia_pithecia_169 NA NA 0 0.012 0.015 0.034
## 80 169 Tayassu_pecari_169 NA NA 0 0.024 0 0.014
## 81 169 Aotus_infulatus_169 NA NA 0 0 0.008 0
## 82 169 bradypus_variegatus_169 NA NA 0 0 0.008 0.007
## 83 169 Leopardus_tigrinus_169 NA NA 0 0 0.008 0
## 84 169 Colinus_cristatus_169 NA NA 0 0 0 0.007
## 85 169 Leopardus_wiedii_169 NA NA 0 0 0 0.007
## 86 169 Tapirus_terrestris_169 NA NA 0 0 0 0.007
## 87 173 Alouatta_juara_173 NA 0.02 0 0.025 0.01 0
## 88 173 Cacajao_melanocephalus_173 NA 0.01 0.036 0.025 0 0
## 89 173 Cebus_albifrons_173 NA 0.02 0.018 0 0 0.01
## 90 173 Choloepus_didactylus_173 NA 0.01 0 0.013 0 0
## 91 173 Dasyprocta_fuliginosa_173 NA 0.05 0.018 0.05 0.029 0.03
## 92 173 Lontra_longicaudis_173 NA 0.01 0.009 0 0 0
## 93 173 Mazama_nemorivaga_173 NA 0.02 0 0.025 0.01 0.01
## 94 173 Microsciurus_flaviventer_173 NA 0.07 0.018 0.025 0 0
## 95 173 Myoprocta_pratti_173 NA 0.13 0.1 0.112 0.124 0.2
## 96 173 NA_173 NA 0.01 0.009 0.025 0.019 0.11
## 97 173 Nothocrax_urumutum_173 NA 0.01 0 0 0 0
## 98 173 Pecari_tajacu_173 NA 0.02 0.045 0.025 0.01 0.02
## 99 173 Penelope_jacquacu_173 NA 0.1 0.109 0.15 0.057 0.09
## 100 173 Pithecia_pithecia_173 NA 0.09 0.073 0.025 0.048 0.06
## 101 173 Puma_concolor_173 NA 0.01 0 0 0 0.01
## 102 173 Saimiri_cassiquiarensis_173 NA 0.02 0.009 0.013 0.019 0
## 103 173 Sapajus_apella_173 NA 0.14 0.182 0.325 0.076 0.2
## 104 173 Urosciurus_igniventris_173 NA 0.05 0.1 0.075 0.114 0.04
## 105 173 Eira_barbara_173 NA 0 0.018 0.013 0.01 0.01
## 106 173 Guerlinguetus_aestuans_173 NA 0 0.018 0.038 0.086 0.04
## 107 173 Leopardus_pardalis_173 NA 0 0.009 0 0 0
## 108 173 Odontophorus_gujanensis_173 NA 0 0.018 0.062 0.01 0.01
## 109 173 Tamandua_tetradactyla_173 NA 0 0.009 0 0.01 0
## 110 173 Tayassu_pecari_173 NA 0 0.009 0.013 0 0
## 111 173 Cebus_unicolor_173 NA 0 0 0.038 0.01 0
## 112 173 Leopardus_tigrinus_173 NA 0 0 0.013 0 0
## 113 173 Pteronura_brasiliensis_173 NA 0 0 0.025 0.01 0
## 114 173 Mazama_americana_173 NA 0 0 0 0.01 0.03
## 115 173 Primates_173 NA 0 0 0 0.01 0
## 116 187 Alouatta_macconnelli_187 0.1 0.075 0.056 0.04 0.125 0.056
## 117 187 Ateles_paniscus_187 0.1 0.05 0.078 0.064 0.042 0.032
## 118 187 Dasyprocta_leporina_187 0.5 0.212 0.289 0.072 0.083 0.144
## 119 187 Myoprocta_acouchy_187 0.3 0.2 0.233 0.136 0.05 0.208
## 120 187 Penelope_marail_187 0.1 0.075 0.022 0.008 0.067 0.04
## 121 187 Saguinus_midas_187 0.4 0.175 0.256 0.16 0.275 0.176
## 122 187 Tinamus_major_187 0.1 0.112 0.267 0.272 0.15 0.24
## 123 187 Crax_alector_187 0 0.075 0.056 0.056 0.05 0.064
## 124 187 Mazama_nemorivaga_187 0 0.013 0.044 0.032 0.025 0.08
## 125 187 Nasua_nasua_187 0 0.025 0 0.008 0 0.016
## 126 187 Pecari_tajacu_187 0 0.013 0.033 0.04 0.008 0.016
## 127 187 Psophia_crepitans_187 0 0.025 0.156 0.128 0.092 0.104
## 128 187 Sapajus_apella_187 0 0.038 0.1 0.08 0.1 0.128
## 129 187 Tamandua_tetradactyla_187 0 0.013 0.011 0.008 0 0
## 130 187 Tayassu_pecari_187 0 0.013 0 0 0.008 0.008
## 131 187 Dasypus_novemcinctus_187 0 0 0.022 0 0 0
## 132 187 Eira_barbara_187 0 0 0.011 0 0 0.016
## 133 187 Guerlinguetus_aestuans_187 0 0 0.033 0.016 0.025 0.016
## 134 187 Leopardus_pardalis_187 0 0 0.011 0 0 0
## 135 187 Mazama_americana_187 0 0 0.022 0.024 0.017 0.016
## 136 187 Panthera_onca_187 0 0 0.011 0.008 0 0.016
## 137 187 Pithecia_pithecia_187 0 0 0.011 0.024 0.042 0
## 138 187 Puma_yagouaroundi_187 0 0 0.011 0 0 0
## 139 187 Sciurillus_pusillus_187 0 0 0.044 0 0 0.024
## 140 187 Tapirus_terrestris_187 0 0 0.011 0 0 0
## 141 187 Cebus_olivaceus_187 0 0 0 0.008 0.017 0.016
## 142 187 Cuniculus_paca_187 0 0 0 0.016 0 0.008
## 143 187 Saimiri_sciureus_187 0 0 0 0.024 0.017 0.016
## 144 187 Odontophorus_gujanensis_187 0 0 0 0 0.008 0.008
## 145 187 NA_187 0 0 0 0 0 0.008
## 146 188 Ateles_chamek_188 NA NA NA 0.2 0.13 0.08
## 147 188 Callicebus_brunneus_188 NA NA NA 0.233 0.1 0.24
## 148 188 Dasyprocta_fuliginosa_188 NA NA NA 0.3 0.15 0.333
## 149 188 Guerlinguetus_aestuans_188 NA NA NA 0.033 0.04 0.08
## 150 188 Mazama_nemorivaga_188 NA NA NA 0.067 0.05 0.08
## 151 188 Myrmecophaga_tridactyla_188 NA NA NA 0.033 0 0
## 152 188 Pecari_tajacu_188 NA NA NA 0.033 0 0.04
## 153 188 Pithecia_irrorata_188 NA NA NA 0.067 0.02 0.093
## 154 188 Saguinus_weddelli_188 NA NA NA 0.067 0.04 0.093
## 155 188 Sapajus_apella_188 NA NA NA 0.1 0.32 0.293
## 156 188 Alouatta_puruensis_188 NA NA NA 0 0.01 0
## 157 188 E_188 NA NA NA 0 0.57 0
## 158 188 Eira_barbara_188 NA NA NA 0 0.01 0.013
## 159 188 Mazama_americana_188 NA NA NA 0 0.01 0.067
## 160 188 Pauxi_tuberosa_188 NA NA NA 0 0.01 0
## 161 188 Psophia_viridis_188 NA NA NA 0 0.01 0.027
## 162 188 Sciurillus_pusillus_188 NA NA NA 0 0.01 0
## 163 188 Tamandua_tetradactyla_188 NA NA NA 0 0.04 0.013
## 164 188 Tapirus_terrestris_188 NA NA NA 0 0.01 0.013
## 165 188 NA_188 NA NA NA 0 0 0.067
## 166 188 Tapirus_kabomani_188 NA NA NA 0 0 0.027
## 167 208 Ateles_chamek_208 NA NA 0.058 0.032 0.065 0.108
## 168 208 Callicebus_bernhardi_208 NA NA 0.05 0.024 0.065 0.138
## 169 208 Callicebus_brunneus_208 NA NA 0.017 0.008 0 0
## 170 208 Chiropotes_albinasus_208 NA NA 0.075 0.072 0.084 0.108
## 171 208 Dasyprocta_fuliginosa_208 NA NA 0.283 0.216 0.252 0.369
## 172 208 Eira_barbara_208 NA NA 0.008 0 0 0.023
## 173 208 Lagothrix_cana_208 NA NA 0.117 0.12 0.297 0.285
## 174 208 Mazama_americana_208 NA NA 0.083 0.04 0.032 0.123
## 175 208 Mazama_nemorivaga_208 NA NA 0.075 0.048 0.045 0.069
## 176 208 Nasua_nasua_208 NA NA 0.008 0 0.013 0.015
## 177 208 Pauxi_tuberosa_208 NA NA 0.05 0.048 0.084 0.131
## 178 208 Pecari_tajacu_208 NA NA 0.025 0.024 0.013 0.038
## 179 208 Penelope_jacquacu_208 NA NA 0.058 0.176 0.123 0.162
## 180 208 Pithecia_irrorata_208 NA NA 0.05 0.008 0.039 0.023
## 181 208 Psophia_viridis_208 NA NA 0.05 0.048 0.071 0.038
## 182 208 Saimiri_ustus_208 NA NA 0.025 0.032 0 0
## 183 208 Sapajus_apella_208 NA NA 0.1 0.096 0.065 0.069
## 184 208 Tamandua_tetradactyla_208 NA NA 0.008 0.032 0.026 0.015
## 185 208 Tinamidae_208 NA NA 0.042 0.12 0 0
## 186 208 Atelocynus_microtis_208 NA NA 0 0.008 0 0
## 187 208 Cerdocyon_thous_208 NA NA 0 0.008 0 0.008
## 188 208 Mico_melanurus_208 NA NA 0 0.008 0 0
## 189 208 Tayassu_pecari_208 NA NA 0 0.008 0.006 0.015
## 190 208 Callitrichidae_208 NA NA 0 0 0.019 0
## 191 208 Myrmecophaga_tridactyla_208 NA NA 0 0 0.006 0
## 192 208 Nothocrax_urumutum_208 NA NA 0 0 0.006 0
## 193 208 Panthera_onca_208 NA NA 0 0 0.013 0
## 194 208 Choloepus_didactylus_208 NA NA 0 0 0 0.008
## 195 208 Leopardus_wiedii_208 NA NA 0 0 0 0.008
## 196 208 NA_208 NA NA 0 0 0 0.031
## 197 208 Puma_yagouaroundi_208 NA NA 0 0 0 0.008
## 198 208 Tapirus_terrestris_208 NA NA 0 0 0 0.023
## 199 211 Alouatta_belzebul_211 NA NA 0.133 0.04 0.038 0.018
## 200 211 Crax_fasciolata_211 NA NA 0.067 0.027 0.075 0.055
## 201 211 Dasyprocta_leporina_211 NA NA 0.233 0.373 0.35 0.464
## 202 211 Eira_barbara_211 NA NA 0.033 0.013 0.013 0
## 203 211 Guerlinguetus_aestuans_211 NA NA 0.033 0.053 0.038 0.073
## 204 211 Mazama_americana_211 NA NA 0.033 0.147 0.1 0.018
## 205 211 Mazama_nemorivaga_211 NA NA 0.033 0 0.013 0.018
## 206 211 Myrmecophaga_tridactyla_211 NA NA 0.033 0 0 0
## 207 211 Nasua_nasua_211 NA NA 0.1 0 0 0.027
## 208 211 Odontophorus_gujanensis_211 NA NA 0.067 0.013 0.062 0
## 209 211 Ortalis_motmot_211 NA NA 0.067 0.013 0 0.055
## 210 211 Pauxi_tuberosa_211 NA NA 0.133 0.133 0.038 0.009
## 211 211 Psophia_interjecta_211 NA NA 0.133 0.027 0.1 0.055
## 212 211 Saimiri_collinsi_211 NA NA 0.167 0.093 0.025 0.073
## 213 211 Sapajus_apella_211 NA NA 0.2 0.107 0.075 0.173
## 214 211 Aburria_cujubi_211 NA NA 0 0.013 0 0.073
## 215 211 Callicebus_moloch_211 NA NA 0 0.027 0.038 0
## 216 211 Callitrichidae_211 NA NA 0 0.013 0 0
## 217 211 Chiropotes_utahickae_211 NA NA 0 0.04 0.05 0.009
## 218 211 Cracidae_211 NA NA 0 0.013 0 0
## 219 211 Cuniculus_paca_211 NA NA 0 0.027 0 0
## 220 211 Hydrochoerus_hydrochaeris_211 NA NA 0 0.013 0 0
## 221 211 Pecari_tajacu_211 NA NA 0 0.027 0.025 0.018
## 222 211 Saguinus_niger_211 NA NA 0 0.227 0.05 0.055
## 223 211 Tayassu_pecari_211 NA NA 0 0.107 0.013 0
## 224 211 Bradypus_variegatus_211 NA NA 0 0 0.013 0
## 225 211 NA_211 NA NA 0 0 0.062 0.191
## 226 211 Sciurillus_pusillus_211 NA NA 0 0 0.038 0.018
## 227 211 Tamandua_tetradactyla_211 NA NA 0 0 0.013 0.027
## 228 211 Tapirus_terrestris_211 NA NA 0 0 0.013 0
## 229 211 Atelocynus_microtis_211 NA NA 0 0 0 0.009
## 230 211 bradypus_variegatus_211 NA NA 0 0 0 0.009
## 231 211 Dasypus_kappleri_211 NA NA 0 0 0 0.009
## 232 211 Priodontes_maximus_211 NA NA 0 0 0 0.009
## 233 211 Puma_concolor_211 NA NA 0 0 0 0.009
## 234 211 Sylvilagus_brasiliensis_211 NA NA 0 0 0 0.009
## 235 211 Tinamidae_211 NA NA 0 0 0 0.064
## 236 213 Alouatta_macconnelli_213 0.043 0.088 0.047 0.023 0.028 0.02
## 237 213 Ateles_paniscus_213 0.235 0.288 0.16 0.146 0.159 0.151
## 238 213 Chiropotes_sagulatus_213 0.078 0.04 0.073 0.046 0.103 0.053
## 239 213 Crax_alector_213 0.165 0.376 0.16 0.108 0.131 0.085
## 240 213 Dasyprocta_leporina_213 0.209 0.472 0.44 0.223 0.241 0.335
## 241 213 Eira_barbara_213 0.009 0.032 0.02 0.023 0.007 0.013
## 242 213 Guerlinguetus_aestuans_213 0.026 0.112 0.187 0 0 0.039
## 243 213 Mazama_americana_213 0.043 0.096 0.047 0.054 0.055 0.039
## 244 213 Mazama_nemorivaga_213 0.009 0.048 0.047 0.008 0 0.007
## 245 213 Myoprocta_acouchy_213 0.609 1.29 1.57 0.731 0.959 1.18
## 246 213 NA_213 0.009 0 0 0 0 0
## 247 213 Nasua_nasua_213 0.009 0.008 0.007 0 0 0.013
## 248 213 Odontophorus_gujanensis_213 0.026 0.04 0.027 0.062 0.048 0.072
## 249 213 Panthera_onca_213 0.009 0.008 0.013 0 0 0
## 250 213 Pecari_tajacu_213 0.087 0.04 0.04 0.023 0.014 0.033
## 251 213 Psophia_crepitans_213 0.122 0.2 0.133 0.123 0.097 0.085
## 252 213 Saguinus_midas_213 0.087 0.032 0.087 0.062 0.034 0.098
## 253 213 Saimiri_sciureus_213 0.017 0.016 0.013 0 0.021 0.007
## 254 213 Sapajus_apella_213 0.191 0.272 0.267 0.254 0.276 0.236
## 255 213 Tamandua_tetradactyla_213 0.017 0.008 0.013 0.008 0.028 0
## 256 213 Tapirus_terrestris_213 0.026 0.032 0 0 0 0
## 257 213 Tinamus_major_213 0.27 0.304 0.493 0.2 0.159 0.25
## 258 213 Aburria_cumanensis_213 0 0.024 0 0.054 0 0.007
## 259 213 Bradypus_variegatus_213 0 0.008 0 0 0 0
## 260 213 Cebus_olivaceus_213 0 0.024 0 0 0 0
## 261 213 Dasypus_novemcinctus_213 0 0.008 0 0 0 0
## 262 213 Leopardus_wiedii_213 0 0.008 0.013 0 0 0
## 263 213 Myrmecophaga_tridactyla_213 0 0.016 0.007 0 0 0
## 264 213 Primates_213 0 0.008 0 0 0 0
## 265 213 Puma_concolor_213 0 0.016 0.007 0 0 0
## 266 213 Tayassu_pecari_213 0 0.016 0.007 0 0 0
## 267 213 Bradypodidae_213 0 0 0.007 0 0 0
## 268 213 Cyclopes_didactylus_213 0 0 0.007 0 0 0
## 269 213 Pithecia_pithecia_213 0 0 0.007 0.015 0.007 0.033
## 270 213 Priodontes_maximus_213 0 0 0.007 0 0 0
## 271 213 Ortalis_motmot_213 0 0 0 0.008 0.007 0.02
## 272 213 Sciuridae_213 0 0 0 0.062 0.076 0
## 273 213 Galictis_vittata_213 0 0 0 0 0.007 0
## 274 213 Leopardus_pardalis_213 0 0 0 0 0.007 0
## 275 222 Alouatta_puruensis_222 NA NA NA NA 0.086 0.16
## 276 222 Aotus_nigriceps_222 NA NA NA NA 0.014 0.008
## 277 222 Callicebus_cupreus_222 NA NA NA NA 0.121 0.16
## 278 222 Callimico_goeldii_222 NA NA NA NA 0.007 0
## 279 222 Callitrichidae_222 NA NA NA NA 0.007 0
## 280 222 Cebuella_pygmaea_222 NA NA NA NA 0.007 0
## 281 222 Cebus_unicolor_222 NA NA NA NA 0.064 0.024
## 282 222 Dasyprocta_fuliginosa_222 NA NA NA NA 0.157 0.144
## 283 222 Eira_barbara_222 NA NA NA NA 0.007 0.008
## 284 222 Guerlinguetus_aestuans_222 NA NA NA NA 0.007 0.008
## 285 222 Mazama_americana_222 NA NA NA NA 0.036 0.016
## 286 222 Mazama_nemorivaga_222 NA NA NA NA 0.014 0
## 287 222 Microsciurus_flaviventer_222 NA NA NA NA 0.014 0.008
## 288 222 Myoprocta_pratti_222 NA NA NA NA 0.014 0.024
## 289 222 Nasua_nasua_222 NA NA NA NA 0.007 0.016
## 290 222 Odontophorus_stellatus_222 NA NA NA NA 0.043 0.032
## 291 222 Ortalis_guttata_222 NA NA NA NA 0.064 0.048
## 292 222 Pecari_tajacu_222 NA NA NA NA 0.043 0.048
## 293 222 Penelope_jacquacu_222 NA NA NA NA 0.229 0.176
## 294 222 Pithecia_irrorata_222 NA NA NA NA 0.014 0.008
## 295 222 Psophia_leucoptera_222 NA NA NA NA 0.029 0.024
## 296 222 Saguinus_imperator_222 NA NA NA NA 0.157 0.168
## 297 222 Saguinus_weddelli_222 NA NA NA NA 0.043 0.096
## 298 222 Saimiri_boliviensis_222 NA NA NA NA 0.2 0.144
## 299 222 Sapajus_macrocephalus_222 NA NA NA NA 0.286 0.232
## 300 222 Tamandua_tetradactyla_222 NA NA NA NA 0.007 0.016
## 301 222 Tapirus_terrestris_222 NA NA NA NA 0.007 0
## 302 222 Tayassu_pecari_222 NA NA NA NA 0.029 0.024
## 303 222 Tinamidae_222 NA NA NA NA 0.029 0
## 304 222 Coendou_prehensilis_222 NA NA NA NA 0 0.008
## 305 222 Dasypus_novemcinctus_222 NA NA NA NA 0 0.008
## 306 222 Myrmecophaga_tridactyla_222 NA NA NA NA 0 0.008
## 307 222 NA_222 NA NA NA NA 0 0.096
## 308 222 Puma_yagouaroundi_222 NA NA NA NA 0 0.008
## 309 232 Aburria_cumanensis_232 0.011 0 0 0 0 0
## 310 232 Alouatta_puruensis_232 0.084 0.118 0.078 0.022 0.1 0.038
## 311 232 Aotus_nigriceps_232 0.074 0.106 0.122 0.022 0.03 0.029
## 312 232 Cabassous_unicinctus_232 0.021 0.012 0 0.011 0 0
## 313 232 Callicebus_cupreus_232 0.189 0.129 0.122 0.078 0.05 0.019
## 314 232 Callimico_goeldii_232 0.042 0.024 0.044 0.022 0.01 0.01
## 315 232 Cebus_unicolor_232 0.063 0.047 0.078 0.089 0.07 0.086
## 316 232 Dasyprocta_fuliginosa_232 0.232 0.271 0.256 0.1 0.17 0.2
## 317 232 Eira_barbara_232 0.042 0.024 0.056 0.011 0.01 0.01
## 318 232 Guerlinguetus_ignitus_232 0.105 0.047 0.056 0 0.16 0.124
## 319 232 Leopardus_tigrinus_232 0.032 0 0 0 0 0
## 320 232 Mazama_americana_232 0.074 0.035 0.056 0.033 0.04 0.029
## 321 232 Microsciurus_flaviventer_232 0.021 0.012 0.067 0.022 0.07 0
## 322 232 Myoprocta_pratti_232 0.084 0.141 0.144 0.067 0.07 0.057
## 323 232 Myrmecophaga_tridactyla_232 0.011 0.035 0.022 0 0 0
## 324 232 Nasua_nasua_232 0.042 0.071 0.056 0.033 0.03 0.019
## 325 232 Odontophorus_stellatus_232 0.011 0.059 0.1 0.044 0.07 0.029
## 326 232 Panthera_onca_232 0.011 0.012 0 0 0.01 0
## 327 232 Pauxi_tuberosa_232 0.011 0.012 0 0 0 0
## 328 232 Pecari_tajacu_232 0.168 0.153 0.111 0.111 0.18 0.095
## 329 232 Penelope_jacquacu_232 0.211 0.2 0.178 0.2 0.27 0.286
## 330 232 Priodontes_maximus_232 0.011 0 0 0 0 0
## 331 232 Psophia_leucoptera_232 0.063 0.071 0.111 0.044 0.06 0.038
## 332 232 Saguinus_imperator_232 0.021 0.071 0.056 0.056 0.06 0.029
## 333 232 Saguinus_weddelli_232 0.021 0.059 0.033 0.089 0.09 0.038
## 334 232 Saimiri_boliviensis_232 0.053 0.047 0.167 0.078 0.08 0.114
## 335 232 Sapajus_macrocephalus_232 0.189 0.153 0.2 0.189 0.16 0.152
## 336 232 Tamandua_tetradactyla_232 0.032 0.082 0.011 0 0 0.01
## 337 232 Leopardus_wiedii_232 0 0.012 0 0.011 0.01 0
## 338 232 Leopardus_pardalis_232 0 0 0.011 0 0 0
## 339 232 Tayassu_pecari_232 0 0 0.011 0 0.01 0
## 340 232 Dasypus_novemcinctus_232 0 0 0 0.011 0.01 0
## 341 232 Galictis_vittata_232 0 0 0 0.011 0 0
## 342 232 Nothocrax_urumutum_232 0 0 0 0.011 0.03 0
## 343 232 Ortalis_guttata_232 0 0 0 0.022 0 0
## 344 232 Puma_concolor_232 0 0 0 0 0.01 0
## 345 232 Puma_yagouaroundi_232 0 0 0 0 0.01 0
## 346 232 Sciuridae_232 0 0 0 0 0.01 0
## 347 232 Speothus_venaticus_232 0 0 0 0 0 0.01
## 348 256 Ateles_chamek_256 NA NA NA 0.078 0.037 0.077
## 349 256 Callicebus_brunneus_256 NA NA NA 0.031 0.056 0.01
## 350 256 Cerdocyon_thous_256 NA NA NA 0.016 0 0.01
## 351 256 Crax_fasciolata_256 NA NA NA 0.016 0 0.01
## 352 256 Cuniculus_paca_256 NA NA NA 0.016 0 0
## 353 256 Dasyprocta_fuliginosa_256 NA NA NA 0.109 0.139 0.184
## 354 256 Mazama_nemorivaga_256 NA NA NA 0.031 0.009 0.029
## 355 256 Ortalis_guttata_256 NA NA NA 0.016 0 0
## 356 256 Pecari_tajacu_256 NA NA NA 0.031 0.074 0.019
## 357 256 Pithecia_irrorata_256 NA NA NA 0.016 0.009 0.039
## 358 256 Saguinus_weddelli_256 NA NA NA 0.016 0.028 0.01
## 359 256 Saimiri_ustus_256 NA NA NA 0.016 0.056 0.077
## 360 256 Sapajus_apella_256 NA NA NA 0.514 0.297 0.338
## 361 256 Tamandua_tetradactyla_256 NA NA NA 0.031 0.009 0
## 362 256 Cebus_unicolor_256 NA NA NA 0 0.037 0.01
## 363 256 Dasypus_kappleri_256 NA NA NA 0 0.009 0
## 364 256 Mazama_americana_256 NA NA NA 0 0.019 0
## 365 256 Myrmecophaga_tridactyla_256 NA NA NA 0 0.009 0
## 366 256 Nasua_nasua_256 NA NA NA 0 0.009 0
## 367 256 Pauxi_tuberosa_256 NA NA NA 0 0.028 0.029
## 368 256 Psophia_viridis_256 NA NA NA 0 0.009 0.01
## 369 256 Tayassu_pecari_256 NA NA NA 0 0.009 0.039
## 370 256 Dasypus_novemcinctus_256 NA NA NA 0 0 0.01
## 371 256 NA_256 NA NA NA 0 0 0.029
## 372 259 Alouatta_nigerrima_259 0.08 0.053 0.035 0.069 0.044 0.041
## 373 259 Bradypus_variegatus_259 0.04 0 0 0.01 0.009 0
## 374 259 Callicebus_hoffmannsi_259 0.06 0.004 0.032 0.027 0.025 0.021
## 375 259 Cebus_unicolor_259 0.02 0 0.014 0.032 0.047 0.038
## 376 259 Chiropotes_albinasus_259 0.04 0.013 0.035 0.049 0.016 0.024
## 377 259 Dasyprocta_croconota_259 0.1 0.529 0.768 0.598 0.584 0.665
## 378 259 Eira_barbara_259 0.04 0.004 0 0.012 0.006 0.006
## 379 259 Guerlinguetus_aestuans_259 0.02 0.044 0.011 0.012 0.006 0.006
## 380 259 Mico_humeralifer_259 0.08 0.013 0.021 0.062 0.053 0.047
## 381 259 Odontophorus_gujanensis_259 0.02 0 0.007 0.012 0.006 0.035
## 382 259 Pauxi_tuberosa_259 0.02 0.018 0.014 0.035 0.013 0.015
## 383 259 Pecari_tajacu_259 0.02 0.022 0.021 0.04 0.034 0.026
## 384 259 Pithecia_irrorata_259 0.08 0 0.011 0.03 0.044 0.038
## 385 259 Sapajus_apella_259 0.16 0.098 0.102 0.22 0.225 0.218
## 386 259 Dasypodidae_259 0 0.004 0.014 0 0 0
## 387 259 Mazama_americana_259 0 0.004 0.035 0.049 0.059 0.106
## 388 259 Myrmecophaga_tridactyla_259 0 0.004 0.004 0.01 0.003 0.003
## 389 259 NA_259 0 0.004 0 0 0 0.026
## 390 259 Nasua_nasua_259 0 0.009 0.039 0.057 0.081 0.071
## 391 259 Panthera_onca_259 0 0.004 0.004 0 0.006 0.003
## 392 259 Psophia_viridis_259 0 0.036 0.028 0.091 0.059 0.05
## 393 259 Saimiri_ustus_259 0 0.009 0.004 0 0.003 0.006
## 394 259 Tapirus_terrestris_259 0 0.004 0 0.005 0.003 0
## 395 259 Tayassu_pecari_259 0 0.009 0.018 0.005 0.013 0.003
## 396 259 Tayassuidae_259 0 0.004 0 0 0 0
## 397 259 Aburria_cujubi_259 0 0 0.007 0.03 0.016 0.009
## 398 259 Aotus_nigriceps_259 0 0 0.004 0.005 0 0
## 399 259 Ateles_chamek_259 0 0 0.004 0 0 0
## 400 259 Cabassous_unicinctus_259 0 0 0.004 0 0 0.003
## 401 259 Choloepus_didactylus_259 0 0 0.004 0.002 0.006 0.003
## 402 259 Cracidae_259 0 0 0.021 0.007 0 0
## 403 259 Cuniculus_paca_259 0 0 0.004 0 0.006 0
## 404 259 Felidae_259 0 0 0.007 0 0 0
## 405 259 Galictis_vittata_259 0 0 0.007 0.007 0.003 0
## 406 259 Mazama_nemorivaga_259 0 0 0.007 0.03 0.05 0.038
## 407 259 Primates_259 0 0 0.007 0 0 0
## 408 259 Sciuridae_259 0 0 0.004 0 0 0
## 409 259 Tinamidae_259 0 0 0.035 0.007 0 0
## 410 259 Cerdocyon_thous_259 0 0 0 0.002 0.003 0
## 411 259 Coendou_prehensilis_259 0 0 0 0.002 0.003 0.003
## 412 259 Cyclopes_didactylus_259 0 0 0 0.002 0 0
## 413 259 Didelphis_marsupialis_259 0 0 0 0.002 0.003 0.006
## 414 259 Leopardus_pardalis_259 0 0 0 0.005 0 0.003
## 415 259 Leopardus_wiedii_259 0 0 0 0.005 0 0.003
## 416 259 Lontra_longicaudis_259 0 0 0 0.002 0 0
## 417 259 Myoprocta_pratti_259 0 0 0 0.02 0 0.038
## 418 259 Ortalis_guttata_259 0 0 0 0.02 0.003 0.006
## 419 259 Puma_concolor_259 0 0 0 0.007 0 0.003
## 420 259 Puma_yagouaroundi_259 0 0 0 0.002 0 0
## 421 259 Sciurillus_pusillus_259 0 0 0 0.002 0.006 0
## 422 259 Tamandua_tetradactyla_259 0 0 0 0.015 0.003 0.003
## 423 259 Dasypus_novemcinctus_259 0 0 0 0 0.013 0.003
## 424 259 Leopardus_tigrinus_259 0 0 0 0 0.003 0
## 425 259 bradypus_variegatus_259 0 0 0 0 0 0.009
## 426 274 Alouatta_juara_274 NA NA NA 0.02 0.021 0
## 427 274 Dasyprocta_fuliginosa_274 NA NA NA 0.14 0.147 0
## 428 274 Guerlinguetus_aestuans_274 NA NA NA 0.02 0.053 0.062
## 429 274 Myoprocta_pratti_274 NA NA NA 0.06 0.158 0.446
## 430 274 Odontophorus_stellatus_274 NA NA NA 0.04 0.116 0.246
## 431 274 Ortalis_guttata_274 NA NA NA 0.02 0 0.031
## 432 274 Panthera_onca_274 NA NA NA 0.02 0 0.015
## 433 274 Pecari_tajacu_274 NA NA NA 0.02 0 0.015
## 434 274 Penelope_jacquacu_274 NA NA NA 0.2 0.442 0.538
## 435 274 Pithecia_irrorata_274 NA NA NA 0.08 0.137 0.169
## 436 274 Saguinus_imperator_274 NA NA NA 0.06 0.074 0.108
## 437 274 Tamandua_tetradactyla_274 NA NA NA 0.02 0.021 0.031
## 438 274 Bradypus_variegatus_274 NA NA NA 0 0.011 0
## 439 274 Cebus_unicolor_274 NA NA NA 0 0.032 0
## 440 274 Eira_barbara_274 NA NA NA 0 0.011 0.031
## 441 274 Lontra_longicaudis_274 NA NA NA 0 0.011 0
## 442 274 Mazama_americana_274 NA NA NA 0 0.042 0
## 443 274 Microsciurus_flaviventer_274 NA NA NA 0 0.011 0.077
## 444 274 Nasua_nasua_274 NA NA NA 0 0.021 0.015
## 445 274 Psophia_leucoptera_274 NA NA NA 0 0.074 0.108
## 446 274 Saimiri_boliviensis_274 NA NA NA 0 0.011 0
## 447 274 Sapajus_macrocephalus_274 NA NA NA 0 0.095 0.108
## 448 274 Canis_familiaris_274 NA NA NA 0 0 0.015
## 449 274 Cebus_albifrons_274 NA NA NA 0 0 0.031
## 450 274 Dasyprocta_cf. fuliginosa_274 NA NA NA 0 0 0.231
## 451 274 Lagothrix_poeppigii_274 NA NA NA 0 0 0.015
## 452 274 Lontra_longicaudata_274 NA NA NA 0 0 0.015
## 453 281 Aburria_cujubi_281 NA NA 0.069 0.036 0.033 0.01
## 454 281 Alouatta_puruensis_281 NA NA 0.021 0.027 0.022 0.02
## 455 281 Aotus_nigriceps_281 NA NA 0.014 0 0 0.02
## 456 281 Ateles_chamek_281 NA NA 0.179 0.273 0.244 0.16
## 457 281 Callicebus_cinerascens_281 NA NA 0.007 0 0.033 0.03
## 458 281 Callicebus_moloch_281 NA NA 0.028 0 0 0.02
## 459 281 Cebus_unicolor_281 NA NA 0.007 0.036 0.011 0
## 460 281 Chiropotes_albinasus_281 NA NA 0.076 0.082 0.044 0.07
## 461 281 Cracidae_281 NA NA 0.014 0 0 0
## 462 281 Crax_fasciolata_281 NA NA 0.014 0 0 0
## 463 281 Dasyprocta_fuliginosa_281 NA NA 0.193 0.209 0.256 0.33
## 464 281 Dasypus_novemcinctus_281 NA NA 0.007 0.009 0 0
## 465 281 Didelphis_marsupialis_281 NA NA 0.007 0.009 0 0
## 466 281 Eira_barbara_281 NA NA 0.007 0.018 0.011 0.01
## 467 281 Galictis_vittata_281 NA NA 0.007 0 0.011 0
## 468 281 Guerlinguetus_aestuans_281 NA NA 0.007 0.009 0.033 0.02
## 469 281 Lagothrix_cana_281 NA NA 0.193 0.164 0.267 0.08
## 470 281 Mazama_americana_281 NA NA 0.048 0.073 0.033 0.01
## 471 281 Mazama_nemorivaga_281 NA NA 0.021 0.082 0.067 0
## 472 281 Mico_melanurus_281 NA NA 0.152 0.136 0.133 0.04
## 473 281 Nasua_nasua_281 NA NA 0.014 0 0.033 0
## 474 281 Panthera_onca_281 NA NA 0.014 0.018 0 0
## 475 281 Pauxi_tuberosa_281 NA NA 0.166 0.182 0.211 0.09
## 476 281 Pecari_tajacu_281 NA NA 0.028 0.073 0.056 0.05
## 477 281 Pithecia_irrorata_281 NA NA 0.034 0.027 0.067 0.03
## 478 281 Priodontes_maximus_281 NA NA 0.014 0 0 0
## 479 281 Procyonidae_281 NA NA 0.007 0 0 0
## 480 281 Psophia_dextralis_281 NA NA 0.014 0.009 0 0
## 481 281 Psophia_viridis_281 NA NA 0.076 0.064 0.044 0.03
## 482 281 Puma_concolor_281 NA NA 0.007 0 0 0
## 483 281 Saimiri_ustus_281 NA NA 0.028 0.055 0.033 0.01
## 484 281 Sapajus_apella_281 NA NA 0.214 0.291 0.211 0.16
## 485 281 Tamandua_tetradactyla_281 NA NA 0.014 0 0 0.01
## 486 281 Tapirus_terrestris_281 NA NA 0.028 0.018 0.022 0
## 487 281 Tayassu_pecari_281 NA NA 0.055 0.018 0.033 0.01
## 488 281 Tinamidae_281 NA NA 0.007 0.009 0.011 0
## 489 281 Cabassous_unicinctus_281 NA NA 0 0.009 0 0
## 490 281 Cerdocyon_thous_281 NA NA 0 0.009 0 0.01
## 491 281 Coendou_prehensilis_281 NA NA 0 0.009 0 0
## 492 281 Leopardus_pardalis_281 NA NA 0 0.018 0 0
## 493 281 Myoprocta_pratti_281 NA NA 0 0.009 0.011 0
## 494 281 Myrmecophaga_tridactyla_281 NA NA 0 0.009 0 0
## 495 281 Pitheciidae_281 NA NA 0 0.009 0 0
## 496 281 Sciurillus_pusillus_281 NA NA 0 0.018 0 0
## 497 281 Hydrochoerus_hydrochaeris_281 NA NA 0 0 0.022 0
## 498 281 NA_281 NA NA 0 0 0 0.11
## 499 281 Puma_yagouaroundi_281 NA NA 0 0 0 0.01
## 500 1633 Ateles_chamek_1633 NA NA NA 0.025 0 0
## 501 1633 Callicebus_dubius_1633 NA NA NA 0.025 0.014 0
## 502 1633 Crax_globulosa_1633 NA NA NA 0.05 0.007 0.015
## 503 1633 Lagothrix_cana_1633 NA NA NA 0.25 0.064 0.115
## 504 1633 Mazama_americana_1633 NA NA NA 0.025 0.007 0
## 505 1633 Mazama_nemorivaga_1633 NA NA NA 0.025 0 0
## 506 1633 Pecari_tajacu_1633 NA NA NA 0.05 0.05 0.023
## 507 1633 Penelope_jacquacu_1633 NA NA NA 0.225 0.186 0.162
## 508 1633 Pithecia_irrorata_1633 NA NA NA 0.2 0.043 0.038
## 509 1633 Psophia_leucoptera_1633 NA NA NA 0.075 0.014 0.038
## 510 1633 Sapajus_macrocephalus_1633 NA NA NA 0.5 0.079 0.138
## 511 1633 Tayassu_pecari_1633 NA NA NA 0.05 0 0
## 512 1633 Aotus_nigriceps_1633 NA NA NA 0 0.014 0
## 513 1633 Atelidae_1633 NA NA NA 0 0.021 0
## 514 1633 Callitrichidae_1633 NA NA NA 0 0.007 0
## 515 1633 Cebidae_1633 NA NA NA 0 0.007 0.015
## 516 1633 Cebus_albifrons_1633 NA NA NA 0 0.086 0.038
## 517 1633 Dasyprocta_fuliginosa_1633 NA NA NA 0 0.05 0.038
## 518 1633 Leopardus_pardalis_1633 NA NA NA 0 0.007 0
## 519 1633 Lontra_longicaudis_1633 NA NA NA 0 0.007 0
## 520 1633 NA_1633 NA NA NA 0 0.007 0.038
## 521 1633 Ozotocerus_bezoarticus_1633 NA NA NA 0 0.007 0
## 522 1633 Pitheciidae_1633 NA NA NA 0 0.007 0
## 523 1633 Saimiri_boliviensis_1633 NA NA NA 0 0.014 0.008
## 524 1633 Sciuridae_1633 NA NA NA 0 0.007 0
## 525 1633 Tayassuidae_1633 NA NA NA 0 0.007 0
## 526 1633 Tinamidae_1633 NA NA NA 0 0.064 0
## 527 1633 Eira_barbara_1633 NA NA NA 0 0 0.008
## 528 1633 Tapirus_terrestris_1633 NA NA NA 0 0 0.015
## 529 1810 Aburria_cujubi_1810 NA NA NA NA 0.017 NA
## 530 1810 Alouatta_nigerrima_1810 NA NA NA NA 0.092 NA
## 531 1810 Ateles_marginatus_1810 NA NA NA NA 0.042 NA
## 532 1810 Callicebus_moloch_1810 NA NA NA NA 0.058 NA
## 533 1810 Cracidae_1810 NA NA NA NA 0.008 NA
## 534 1810 Dasyprocta_leporina_1810 NA NA NA NA 0.858 NA
## 535 1810 Eira_barbara_1810 NA NA NA NA 0.017 NA
## 536 1810 Guerlinguetus_gilvigularis_1~ NA NA NA NA 0.083 NA
## 537 1810 Mazama_americana_1810 NA NA NA NA 0.075 NA
## 538 1810 Mazama_nemorivaga_1810 NA NA NA NA 0.025 NA
## 539 1810 Mico_argentatus_1810 NA NA NA NA 0.075 NA
## 540 1810 Nasua_nasua_1810 NA NA NA NA 0.017 NA
## 541 1810 Ortalis_motmot_1810 NA NA NA NA 0.017 NA
## 542 1810 Pauxi_tuberosa_1810 NA NA NA NA 0.075 NA
## 543 1810 Pecari_tajacu_1810 NA NA NA NA 0.017 NA
## 544 1810 Psophia_dextralis_1810 NA NA NA NA 0.017 NA
## 545 1810 Saimiri_ustus_1810 NA NA NA NA 0.008 NA
## 546 1810 Sapajus_apella_1810 NA NA NA NA 0.25 NA
## 547 1810 Tayassu_pecari_1810 NA NA NA NA 0.008 NA
## 548 1810 Cuniculus_paca_1810 NA NA NA NA 0 NA
## 549 1810 Leopardus_wiedii_1810 NA NA NA NA 0 NA
## 550 1810 NA_1810 NA NA NA NA 0 NASelecionar populações com taxa de avistamento média acima de 0.1 (1 ind/10km)
taxas_anuais <- taxas_anuais %>%
mutate(media = rowMeans(.[,3:8])) %>%
filter(media > 0.1) %>%
select(-media)
taxas_anuais#print(taxas_anuais, n=Inf)